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华大智造发布新款测序仪,一天能完成60例个人全基因组测序

第一财经 2018-10-25 19:23:58

作者:段倩倩    责编:刘佳

仅以速度来看,MGISEQ-T7已经优于Illumina最新的测序仪NovaSeq 6000。

比之已经上市的华大基因,华大控股实际控制的华大智造似乎更加吸引眼球,后者主要业务为基因测序仪的生产,是整个基因检测产业链中护城河最高的一环。

10月25日,华大智造发布了其最新超高通量基因测序仪——“MGISEQ-T7”。根据华大智造的表述,这台测序仪是全球日生产能力最强的基因测序仪。

Illumina永远在那里。“世界上90%以上的测序数据是利用Illumina仪器产生的”这句话挂在Illumina官网上。仅以速度这一维度来看,MGISEQ-T7已经优于Illumina最新的测序仪NovaSeq 6000。

速度优势

华大智造方面称,MGISEQ-T7是全球日生产能力较强的基因测序仪。市场上测序仪最多只能支持两张芯片同时运行,而T7支持“4卡4待”。

“4联芯片平台采用独特的芯片搭载技术,可实现4张芯片进行完全独立的测序流程,如同4台测序仪同时进行工作,且芯片间互不影响。”华大智造执行副总裁刘健称。

这使得MGISEQ-T7日产出数据达6Tb。这也意味着,一台MGISEQ-T7一天就可以完成60例个人全基因组测序,将大幅提高基因组测序效率。以往大规模人群基因组测序效率低下问题有望得到改善——十万人级别的基因组测序可能需要4到6年的时间才能完成。

以英国为例,2012年12月,英国启动十万人基因组计划。可直到2018年7月,5年半时间过去以后,才有7万多例全基因组完成测序。

同样的工作量,仅需6台MGISEQ-T7花一年时间即可完成。“(MGISEQ-T7)速度比别人快近一倍,成本比以往更接近100美元。”刘健表示。

“100美金完成一个人全基因组测序”是基因测序行业的共同目标,全球基因测序从业者都在为此冲刺。要知道,全球基因测序龙头Illumina直到今天都在引以为傲2010年将这项检测成本控制在1000美元;2017年1月,发布新一代测序仪NovaSeq时,Illumina对外口径是“Novaseq能让基因组测序进入100美元的时代”。

仅以日产出6TB数据的速度来看,MGISEQ-T7已经超过Illumina最新的测序仪。Illumina官网显示,NovaSeq 6000系统最大输出为6000Gb(接近6TB),运行时间为19–40小时。如果要完成6000Gb的输出量,运行时间为40小时,接近于华大智造的2倍。

除了速度,Read数和读长同样是基因测序仪重要参数。华大智造没有公布MGISEQ-T7更详细的参数。官网显示,华大智造上一台基因测序仪为MGISEQ-2000最大通量为1080Gb,有效Read数为>18亿,最大读长为PE150。

Illumina官网显示,NovaSeq 6000系统每次运行获得的最大read数为200亿,最大读长为2*150bp。

华大智造超过一半人员为研发

某种意义上,华大智造脱胎换骨自曾经的美国测序仪上市公司CG,2016年起开始自成体系。

2013年,不甘受制于人的华大控股收购CG,向基因检测上游领域延长产业链,开启了基因测序仪国产化进程。基因检测仪正是基因检测产业链中护城河最高的环节。

华大基因招股书显示,华大智造系CG公司二级子公司,CG公司系华大控股(华大基因控股股东)二级子公司。

2014年及以前,CG公司为华大基因基因测序仪供应商,但2016年起,这一角色由香港设备、华大智造承担。

除了最新发布的BGISEQ-T7,华大智造还有BGISEQ-50、MGISEQ-200、BGISEQ-500、MGISEQ-2000等四种不同型号的基因测序仪。

“华大智造来有800多人,这当中研发(人员)占了最大的份额,加上美国我们全球的研发(人员)占比超过50%。” 华大集团执行副总裁、华大智造总裁余德健接受媒体采访时表示。

拥有同一个实际控制人,华大基因系华大智造关联公司。除了华大基因,华大智造有无其它客户?

“现在华大智造在全球有上百家客户,分布在12个国家,安装了近1000台设备。”余德建称。

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